کینسر کے خلاف چوکی: یونیورسل کینسر صرف مارکر

منی جائزہ

کینسر کے خلاف چوکی: یونیورسل کینسر صرف مارکر

Chengchen Qian1، Xiaolong Zou2، Wei Li1,3، Yinshan Li4، Wenqiang Yu5

1Shanghai Epiprobe Biotechnology Co., Ltd, Shanghai 200233, China;2 ڈیپارٹمنٹ آف جنرل سرجری، ہاربن میڈیکل یونیورسٹی کا پہلا منسلک ہسپتال، ہاربن 150001، چین؛3Shandong Epiprobe Medical Laboratory Co., Ltd, Heze 274108, China;4 پیپلز ہاسپٹل آف ننگزیا ہوئی خود مختار علاقہ، ننگزیا میڈیکل یونیورسٹی، ین چوان 750002، چین؛5شنگھائی پبلک ہیلتھ کلینکل سنٹر اور شعبہ جنرل سرجری، ہواشان ہسپتال اور کینسر میٹاسٹیسیس انسٹی ٹیوٹ اور آر این اے ایپی جینیٹکس کی لیبارٹری، انسٹی ٹیوٹ آف بایومیڈیکل سائنسز، شنگھائی میڈیکل کالج، فوڈان یونیورسٹی، شنگھائی 200032، چین

خلاصہ

کینسر دنیا بھر میں موت کی سب سے بڑی وجہ ہے۔کینسر کا جلد پتہ لگانے سے کینسر کی تمام اقسام کی اموات کو کم کیا جا سکتا ہے۔تاہم، کینسر کی زیادہ تر اقسام کے لیے ابتدائی پتہ لگانے والے موثر بائیو مارکر کی کمی ہے۔ڈی این اے میتھیلیشن ہمیشہ دلچسپی کا ایک بڑا ہدف رہا ہے کیونکہ ڈی این اے میتھیلیشن عام طور پر دیگر قابل شناخت جینیاتی تبدیلیوں سے پہلے ہوتا ہے۔ڈی این اے میتھیلیشن کے لیے ایک ناول گائیڈ پوزیشننگ سیکوینسنگ کا استعمال کرتے ہوئے کینسر کی عام خصوصیات کی چھان بین کرتے ہوئے، صرف یونیورسل کینسر کے مارکر (UCOMs) کی ایک سیریز کینسر کی مؤثر اور درست جلد پتہ لگانے کے لیے مضبوط امیدوار کے طور پر سامنے آئی ہے۔اگرچہ موجودہ کینسر کے بائیو مارکر کی طبی قدر کم حساسیت اور/یا کم خصوصیت کی وجہ سے کم ہو گئی ہے، UCOMs کی منفرد خصوصیات طبی لحاظ سے بامعنی نتائج کو یقینی بناتی ہیں۔پھیپھڑوں، سروائیکل، اینڈومیٹریل، اور یوروتھیلیل کینسر میں UCOMs کی طبی صلاحیت کی توثیق کینسر کی متعدد اقسام اور مختلف طبی منظرناموں میں UCOMs کے اطلاق کی مزید حمایت کرتی ہے۔درحقیقت، UCOMs کی ایپلی کیشنز فی الحال کینسر کی جلد پتہ لگانے، معاون تشخیص، علاج کی افادیت، اور تکرار کی نگرانی میں مزید جانچ کے ساتھ فعال تفتیش کے تحت ہیں۔مالیکیولر میکانزم جس کے ذریعے UCOMs کینسر کا پتہ لگاتے ہیں وہ اگلے اہم موضوعات ہیں جن کی تحقیقات کی جائیں گی۔حقیقی دنیا کے منظرناموں میں UCOMs کے اطلاق کے لیے بھی نفاذ اور تطہیر کی ضرورت ہوتی ہے۔

مطلوبہ الفاظ

کینسر کا پتہ لگانا؛کینسر کی اسکریننگ؛ڈی این اے میتھیلیشن؛کینسر ایپی جینیٹکس؛کینسر بائیو مارکر

ہمیں فوری طور پر نئے کی ضرورت کیوں ہے۔ بائیو مارکر؟

ایک صدی سے زیادہ عرصے تک کینسر سے لڑنے کے بعد، کینسر اب بھی بنی نوع انسان کے لیے سب سے زیادہ مہلک حیاتیاتی خطرہ ہے۔20201 میں 19.3 ملین نئے کیسز اور تقریباً 10 ملین اموات کے ساتھ کینسر عالمی صحت کا مسئلہ بنا ہوا ہے۔ 2020 میں چین میں کینسر کے 4.6 ملین نئے کیسز کی تشخیص ہوئی، جو کہ GLOBOCAN1 کے مطابق عالمی سطح پر کینسر کے 23.7 فیصد نئے کیسز ہیں۔مزید برآں، چین میں 2020 میں تقریباً 30 لاکھ اموات کینسر کی وجہ سے ہوئیں، جو کہ کینسر سے ہونے والی عالمی اموات کا 30 فیصد ہیں۔ان اعدادوشمار سے ظاہر ہوتا ہے کہ چین کینسر کے واقعات اور اموات کی شرح میں پہلے نمبر پر ہے۔مزید یہ کہ، 5 سالہ کینسر سے بچنے کی شرح 40.5% ہے، جو کہ ریاستہائے متحدہ میں 5 سالہ بقا کی شرح سے 1.5 گنا کم ہے 2,3۔اعلی انسانی ترقی کے اشاریہ جات والے ممالک کے مقابلے چین میں نسبتاً کم بقا اور اموات کی زیادہ شرح بتاتی ہے کہ کینسر کی روک تھام اور نگرانی کے نظام کی فوری ضرورت ہے۔کینسر کا جلد پتہ لگانا صحت کی دیکھ بھال کے نظام میں سب سے اہم عناصر میں سے ایک ہے۔کینسر کا ابتدائی پتہ لگانے سے کینسر کی تقریباً تمام اقسام میں ابتدائی مرحلے میں تشخیص اور بقا کو بہتر بنایا جا سکتا ہے۔اسکریننگ کی کامیاب حکمت عملیوں نے گریوا، چھاتی، کولوریکٹل، اور پروسٹیٹ کینسر کے واقعات اور اموات کی شرح میں نمایاں کمی کی ہے۔

کینسر کا جلد پتہ لگانا، تاہم، کوئی آسان کام نہیں ہے۔ابتدائی کینسر کی حیاتیات اور تشخیص کی تحقیقات، قابل اعتماد ابتدائی پتہ لگانے والے بائیو مارکر کی شناخت اور ان کی توثیق، اور قابل رسائی اور درست ابتدائی پتہ لگانے والی ٹیکنالوجیز کو تیار کرنا اس عمل میں ہمیشہ سب سے بڑی رکاوٹیں رہی ہیں۔کینسر کی درست شناخت مہلک گھاووں سے سومی کو ممتاز کر سکتی ہے، جو غیر ضروری طریقہ کار سے بچنے میں مدد کرتا ہے اور بیماری کے مزید انتظام میں سہولت فراہم کرتا ہے۔موجودہ ابتدائی پتہ لگانے کی حکمت عملیوں میں اینڈوسکوپ پر مبنی بایپسیز، میڈیکل امیجنگ، سائیٹولوجی، امیونوساز، اور بائیو مارکر ٹیسٹ 5-7 شامل ہیں۔مداخلت کرنے والی اور مہنگی ہونے کی وجہ سے، اینڈوسکوپ پر مبنی بایپسی ایک بڑے طبی طریقہ کار کے طور پر پیشہ ور افراد پر انحصار کرتے ہوئے فطری طور پر بھاری بوجھ اٹھاتی ہے۔سائٹولوجی کی طرح، اسکریننگ کے دونوں طریقے طبی پیشہ ور افراد پر منحصر ہیں اور ذاتی فیصلے پر مبنی کارکردگی کے ساتھ جو مثالی8 سے دور ہے۔اس کے برعکس، اعلی غلط مثبت شرحوں کے پیش نظر، امیونوساز انتہائی غلط ہیں۔میڈیکل امیجنگ، اسکریننگ کے حربے کے طور پر، مہنگے آلات اور خصوصی تکنیکی ماہرین کی ضرورت ہوتی ہے۔لہذا، کم رسائی کی وجہ سے طبی امیجنگ انتہائی محدود ہے۔ان تمام وجوہات کی بناء پر، بائیو مارکر کینسر کی جلد تشخیص کے لیے بہتر آپشن دکھائی دیتے ہیں۔

خط و کتابت: ینشان لی اور وینکیانگ یو

Email: liyinshan@nxrmyy.com and wenqiangyu@fudan.edu.cn

ORCID ID: https://orcid.org/0009-0005-3340-6802 اور

https://orcid.org/0000-0001-9920-1133

22 اگست 2023 کو موصول ہوا؛12 اکتوبر 2023 کو قبول کیا گیا؛

28 نومبر 2023 کو آن لائن شائع ہوا۔

www.cancerbiomed.org پر دستیاب ہے۔

©2023 کینسر بیالوجی اور میڈیسن۔تخلیق مشترک

انتساب-غیر تجارتی 4.0 بین الاقوامی لائسنس

بائیو مارکرز کو فی الحال پروٹین، ڈی این اے میوٹیشن مارکر، ایپی جینیٹک مارکر، کروموسومل اسامانیتاوں، ٹیومر سے براہ راست اخذ کردہ آر این اے مارکر، یا جسمانی رطوبتوں سے بالواسطہ طور پر حاصل کردہ ٹیومر کے ٹکڑے کے طور پر درجہ بندی کیا گیا ہے۔پروٹین مارکر کینسر کی اسکریننگ اور تشخیص میں سب سے زیادہ استعمال کیے جانے والے بائیو مارکر ہیں۔پروٹین بائیو مارکر، بطور اسکریننگ بائیو مارکر، سومی گھاووں سے متاثر ہونے کے رجحان سے محدود ہوتے ہیں، جو زیادہ تشخیص اور زیادہ علاج کا باعث بنتے ہیں، جیسا کہ α-fetoprotein اور پروسٹیٹ مخصوص اینٹیجن (PSA)9,10 کے لیے رپورٹ کیا گیا ہے۔آر این اے مارکروں میں جینیاتی اظہار کے نمونے اور دیگر غیر کوڈنگ والے آر این اے مارکر شامل ہیں۔ جینیاتی اظہار کے آر این اے مارکر کے امتزاج کو پیشاب کے نمونوں کا استعمال کرتے ہوئے پتہ لگایا جا سکتا ہے، جس کی حساسیت بنیادی ٹیومر کے لیے تسلی بخش (60٪) سے بہت دور تھی، اور جس کا پتہ لگانا ممکن ہو سکتا ہے۔ نارمل ماحول میں آر این اے کی آسانی سے انحطاط کی نوعیت سے متاثر ہونا۔جینیاتی اور ایپی جینیٹک مارکر دونوں کو ٹیومر میں پھیلاؤ اور کینسر کی اقسام تک محدود ہونے کے مسئلے کا سامنا ہے۔

ڈی این اے میتھیلیشن 198312 میں فینبرگ کے ذریعہ پہلی بار کینسر سے منسلک ہونے کے بعد سے ابتدائی پتہ لگانے والے بائیو مارکر کے طور پر ایک مضبوط امیدوار ہے۔Aberrant DNA hypermethylation عام طور پر CpG جزیروں پر جین پروموٹرز میں ہوتا ہے تاکہ ٹیومر کو دبانے والوں کا مقابلہ کیا جا سکے 13,14۔مطالعات نے یہ بھی تجویز کیا ہے کہ غیر معمولی ڈی این اے ہائپر میتھیلیشن ترقیاتی ریگولیٹرز کی اپ گریجشن میں مشغول ہے۔ڈی این اے میتھیلیشن ویلی، جو عام طور پر ڈیولپمنٹ ریگولیٹرز اور ہائپر میتھلیٹیڈ کینسر سے وابستہ ہے، جین ایکسپریشن موڈ کو زیادہ مستحکم ڈی این اے میتھیلیشن پر منحصر موڈ میں تبدیل کر سکتی ہے اور میتھلیٹڈ ہسٹون H3K27me3 اور متعلقہ پولی کامب پروٹینز 16,17 سے تعلق کو کم کر سکتی ہے۔

شائع شدہ ڈی این اے میتھیلیشن مارکروں کی بڑی تعداد میں سے، کئی نے کامیابی کے ساتھ مارکیٹ میں ڈیبیو کیا ہے۔تاہم، موجودہ کمرشلائزڈ ڈی این اے میتھیلیشن مارکر اور تشخیصی پینل نے ابھی تک متعدد وجوہات کی بنا پر کینسر کی جلد تشخیص کی صلاحیت کو مکمل طور پر کھولنا ہے۔جب کہ زیادہ تر ڈیٹا بیس کی معلومات کا استعمال کرتے ہوئے قابل قبول کارکردگی دکھاتے ہیں، یہ بائیو مارکر عام طور پر حقیقی دنیا میں کم مثالی کارکردگی دکھاتے ہیں اس حقیقت کی وجہ سے کہ حقیقی دنیا کے نمونے اکثر زیادہ پیچیدہ ہوتے ہیں اور ڈیٹا بیس میں منتخب کیے گئے نمائندے نہیں ہوتے۔اگلی نسل کی ترتیب پر مبنی ملٹی کینسر میتھیلیشن کا ابتدائی پتہ لگانے میں بالترتیب اسٹیج I اور II کے کینسر میں محض 16.8% اور 40.4% حساسیت دکھائی گئی ہے۔ابتدائی پتہ لگانے کے ٹیسٹ میں زیادہ استحکام اور زیادہ درست بائیو مارکر کی ضرورت ہوتی ہے۔

گائیڈ پوزیشننگ سیکوینسنگ (GPS) کا استعمال کرتے ہوئے یونیورسل کینسر صرف مارکر (UCOM) کی دریافت

کینسر کی کئی دہائیوں کی تحقیق کے باوجود تسلی بخش روک تھام اور علاج نہیں ہو سکا ہے۔محققین کو کینسر کا مکمل جائزہ لینے کے قابل بنانے کے لیے نئے طریقوں کی ضرورت ہے۔پچھلے 23 سالوں میں، کینسر کے 6 نشانات، جیسے کہ اپوپٹوسس سے بچنا، ٹشو انویوژن اور میٹاسٹیسیس وغیرہ، کو غیر میوٹیشنل ایپی جینیٹک ری پروگرامنگ اور پولیمورفک مائکرو بایوم 20,21 جیسی خصوصیات کو شامل کرکے 14 تک بڑھا دیا گیا ہے۔جیسے جیسے کینسر سے متعلق مزید تفصیلات سامنے آتی ہیں، کینسر کی تحقیق میں مزید نقطہ نظر متعارف کرائے جاتے ہیں۔کینسر کی تحقیق آہستہ آہستہ دو سمتوں (مشترکہ اور انفرادیت) میں ایک نئی شکل میں آ گئی ہے۔حالیہ برسوں میں صحت سے متعلق آنکالوجی کی ترقی کے ساتھ، کینسر کی تحقیق کا مرکز انفرادی ٹارگٹڈ تھراپی اور کینسر کی ہیٹروجنیٹی کی طرف جھکاؤ ہے۔اس طرح، حال ہی میں شناخت شدہ کینسر کے بائیو مارکر نے بنیادی طور پر کینسر کی مخصوص اقسام پر توجہ مرکوز کی ہے، جیسے کہ PAX6 جبری کینسر 23 اور BMP3 کولوریکٹل کینسر24 کے لیے۔کینسر کی اقسام کے لیے مخصوص ان بائیو مارکرز کی کارکردگی مختلف ہوتی ہے، لیکن حیاتیاتی نمونوں کے حصول کی محدودیت اور زیادہ لاگت کی وجہ سے حساس افراد کے لیے بیک وقت تمام کینسروں کی اسکریننگ کرنا ممکن نہیں ہے۔یہ مثالی ہوگا اگر ہم ایک واحد، مضبوط بائیو مارکر کی شناخت کر سکیں جو ابتدائی مرحلے میں تمام قسم کے کینسر کے لیے موثر ہو۔

ایسے مثالی مقصد کو حاصل کرنے کے لیے، ممکنہ بائیو مارکر اقسام کی فہرست میں سے ایک بہتر بائیو مارکر امیدوار کو منتخب کیا جانا چاہیے۔ڈی این اے میتھیلیشن کی خرابیاں، تمام جینیاتی اور ایپیجنیٹک پروفائلز کے درمیان، کینسر سے متعلق معلوم ہوتی ہیں اور یہ سب سے قدیم ہیں، اگر پہلے نہیں تو، کینسر سے متعلق اسامانیتاوں کو تاریخ کے لحاظ سے پیش آنے والا ہے۔ڈی این اے میتھیلیشن کی تحقیقات جلد شروع ہوئی، لیکن تحقیقی طریقوں کی کمی کی وجہ سے اس میں رکاوٹ پیدا ہوئی ہے۔جینوم میں 28 ملین ممکنہ میتھلیٹیڈ سی پی جی سائٹس میں سے، ٹیومرجینیسیس کو بہتر طور پر سمجھنے کے لیے ایک قابل انتظام نمبر کا پتہ لگانا اور جینوم کے ساتھ منسلک ہونا ضروری ہے۔مکمل جینوم بیسلفائٹ سیکوینسنگ (WGBS)، جسے ڈی این اے میتھیلیشن سیکوینسنگ کا گولڈ اسٹینڈرڈ سمجھا جاتا ہے، بیسلفائٹ ٹریٹمنٹ کی نوعیت کی وجہ سے کینسر کے خلیات میں صرف 50 فیصد Cs کا احاطہ کر سکتا ہے جو ڈی این اے کے ٹکڑوں کو توڑتا ہے اور جینوم کی پیچیدگی کو کم کرتا ہے۔ Cs سے Ts25 کی تبدیلی۔دوسرے طریقے، جیسے کہ 450k چپس، صرف 1.6% جینوم میتھیلیشن کا احاطہ کرتے ہیں۔450k ڈیٹا کی بنیاد پر، DNA میتھیلیشن کا پتہ لگانے والے پینل میں 6 قسم کے اسٹیج I کینسر26 کے لیے 35.4% حساسیت ہے۔کینسر کی اقسام کی حدود، خراب کارکردگی، اور تجزیاتی عمل میں پتہ لگانے کے طریقوں سے پیدا ہونے والا شور پین کینسر کا پتہ لگانے والے پینلز کے لیے سب سے بڑی رکاوٹ بن گئے ہیں۔

ٹیومرجینیسیس اور میٹاسٹیسیس کے دوران خلیوں کے ایپی جینیٹک نمونوں کی بہتر طور پر چھان بین کرنے کے لیے، ہم نے جینوم وسیع DNA میتھیلیشن کا پتہ لگانے کے لیے ایک منفرد GPS تیار کیا، جو 0.4 بلین ریڈز25 میں 96% CpG سائٹس کا احاطہ کرتا ہے۔جی پی ایس ایک دو طرفہ ترتیب کا طریقہ ہے جو بیسلفائٹ ٹریٹمنٹ کے بعد غیر تبدیل شدہ میتھائل-سائٹوسائنز کے ڈی این اے فریگمنٹ کے 3′ سرے کا استعمال کرتا ہے جو پیئر اینڈ سیکوینسنگ (شکل 1) 25 کے ذریعے 5′ سرے کے DNA میتھیلیشن کیلکولیشن کی سیدھ میں رہنمائی کرتا ہے۔میتھائل-سائٹوسین گائیڈنگ اسٹرینڈ، ایک ٹیمپلیٹ اسٹرینڈ کے طور پر کام کرتا ہے، ہائی-جی سی ریجن کی سیدھ میں مدد کرتا ہے جو روایتی WGBS میں سب سے زیادہ ترک کیے گئے سیکوینسنگ ڈیٹا کو بازیافت کرتا ہے۔GPS کی اعلی کوریج کی خصوصیت DNA میتھیلیشن معلومات کی ایک بہت بڑی مقدار فراہم کرتی ہے، جو ہمیں پہلے زیر تفتیش علاقوں میں کافی زیادہ ریزولوشن کے ساتھ کینسر میتھیلیشن پروفائلز کی جانچ کرنے کی اجازت دیتی ہے۔

GPS ہمیں کینسر کی یکسانیت کی تحقیقات کے لیے ایک طاقتور ٹول فراہم کرتا ہے، جو کینسر کی تحقیق کو بہت آسان بنا سکتا ہے اور ممکنہ طور پر tum-origenesis اور metastasis کے لیے عالمگیر وضاحت تلاش کر سکتا ہے۔کینسر سیل لائنوں کے GPS ڈیٹا کا تجزیہ کرتے ہوئے، ایک منفرد واقعہ کا اکثر سامنا ہوا۔ایسے بہت سے علاقے تھے جو کینسر کے متعدد نمونوں میں غیر معمولی طور پر ہائپر میتھلیٹڈ دکھائی دیتے ہیں۔اس غیر متوقع تلاش کو بعد میں UCOMs کے طور پر کام کرنے کے لیے توثیق کیا گیا۔The Cancer Genome Atlas (TCGA) ڈیٹا بیس میں کینسر کی 17 اقسام کے 7,000 سے زیادہ نمونوں کا تجزیہ کیا گیا ہے، جن میں سے ہم نے پہلے UCOM، HIST1H4F کی نشاندہی کی، جو ہسٹون سے متعلق ایک جین ہے جو ہر قسم کے کینسر میں ہائپر میتھلیٹیڈ ہے۔اس کے بعد TCGA ڈیٹا بیس، جین ایکسپریشن اومنیبس (GEO) ڈیٹا بیس، اور حقیقی دنیا کے طبی نمونوں میں UCOMs کا ایک سلسلہ پایا گیا اور ان کی توثیق کی گئی۔ابھی تک، HIST1H4F، PCDHGB7، اور SIX6 کو UCOMs کے طور پر پایا اور توثیق کیا گیا ہے۔UCOMs کی غیر متوقع دریافت کینسر کے جلد پتہ لگانے کی ضرورت کا ایک طاقتور جواب پیش کرتی ہے۔UCOMs ایک سے زیادہ کینسر کے سنگل مارکر کا پتہ لگانے کا حل فراہم کرتے ہیں۔

UCOMs کی خصوصیات

توثیق کے بعد، UCOMs کو چار اہم خصوصیات کی نمائش کرتے ہوئے دکھایا گیا ہے جو UCOMs کو موجودہ بائیو مارکر (شکل 2) کی افادیت کو پیچھے چھوڑنے کے قابل بناتے ہیں۔

بدنیتی سے منفرد

UCOMs کینسر یا کینسر سے پہلے کے گھاووں کے لیے منفرد ہیں اور عام جسمانی تبدیلیوں سے متاثر نہیں ہوتے ہیں۔کینسر سے متعلق کچھ موجودہ مارکر جو ابتدائی پتہ لگانے اور/یا اسکریننگ میں بڑے پیمانے پر لاگو ہوتے ہیں زیادہ تشخیص کا باعث بنے ہیں۔ایلیویٹڈ PSA لیولز، ایک طبی طور پر تسلیم شدہ اسکریننگ ٹول، بھی سومی حالات، جیسے پروسٹیٹ ہائپرپلاسیا اور پروسٹیٹائٹس10 میں پایا جاتا ہے۔زیادہ تشخیص اور اس کے نتیجے میں زیادہ علاج آنتوں، پیشاب اور جنسی پیچیدگیوں کی وجہ سے معیار زندگی کو کم کر دیتا ہے۔طبی ترتیب میں دیگر پروٹین پر مبنی اور بڑے پیمانے پر استعمال ہونے والے بائیو مارکر، جیسے CA-125، نے زیادہ تشخیص اور زیادہ علاج کے دوران کوئی خاص فائدہ نہیں اٹھایا۔خرابی کے لیے UCOMs کی اعلیٰ خصوصیت ان کمیوں سے بچتی ہے۔UCOM، PCDHGB7، اعلی درجے کے اسکواومس انٹراپیتھیلیل گھاووں (HSILs) اور گریوا کے کینسر کو عام نمونوں اور کم درجے کے اسکواومس انٹراپیتھیلیل گھاووں (LSILs) سے مؤثر طریقے سے ممتاز کرتا ہے، جب کہ زیادہ تر دیگر بائیو مارکر صرف گریوا کے کینسر کو عام نمونوں سے الگ کر سکتے ہیں۔اگرچہ PCDHGB7 نارمل اینڈومیٹریئم اور اینڈومیٹریال ہائپرپالسیا کے درمیان اہم فرق کا پتہ نہیں لگاتا ہے، لیکن نارمل اینڈومیٹریئم اور atypical ہائپرپالسیا کے درمیان اہم فرق کا پتہ چلا ہے، اور PCDHGB731 کی بنیاد پر نارمل اینڈومیٹریئم اور اینڈومیٹریال کینسر (EC) کے درمیان اس سے بھی زیادہ فرق کا پتہ چلا ہے۔UCOMs ڈیٹا بیس اور طبی نمونوں میں مہلک گھاووں کے لیے منفرد ہیں۔مریض کے نقطہ نظر سے، منفرد UCOMs مختلف خراب کارکردگی کا مظاہرہ کرنے والے غیر مستحکم بائیو مارکرز اور تشخیص کے عمل کے دوران متعلقہ تشویش کے پیچیدہ اشارے کو سمجھنے کی حد کو کم کرتے ہیں۔کلینشین کے نقطہ نظر سے، منفرد UCOMs مہلک زخموں کو سومی گھاووں سے ممتاز کرتے ہیں، جو مریضوں کی آزمائش میں مدد کرتے ہیں اور غیر ضروری طبی طریقہ کار اور زیادہ علاج کو کم کرتے ہیں۔لہذا، منفرد UCOMs طبی نظام کی فالتو پن کو کم کرتے ہیں، نظام کی پریشانی کو دور کرتے ہیں، اور ضرورت مندوں کو مزید طبی وسائل مہیا کرتے ہیں۔

شکل 1 ڈی این اے میتھیلیشن کا پتہ لگانے کے لیے GPS ورک فلو کا اسکیمیٹک۔گرے لائن: ان پٹ ڈی این اے کی ترتیب؛سرخ لکیر: DNA کا علاج T4 DNA پولیمریز کے ساتھ کیا گیا، ان پٹ کے 3′ سرے پر cytosine کو 5′-methylcytosine سے تبدیل کرنا۔میرے ساتھ نیلا سی: میتھلیٹیڈ سائٹوسین؛بلیو سی: غیر میتھلیٹیڈ سائٹوسین؛پیلا ٹی: تھامین 25۔

تمام یا کچھ بھی نہیں

UCOMs صرف کینسر کے خلیوں میں موجود ہوتے ہیں اور تقریباً تمام کینسر کے خلیوں میں ان کا پتہ چلتا ہے۔HIST1H4F کو ٹیومر کی تقریباً تمام اقسام میں ہائپر میتھلیٹڈ ہونے کی توثیق کی گئی تھی لیکن عام نمونوں میں نہیں۔اسی طرح، پی سی ڈی ایچ جی بی 7 اور ایس آئی ایکس 6 کو بھی ٹیومر کے تمام نمونوں میں ہائپر میتھلیٹڈ دکھایا گیا ہے لیکن عام نمونوں 30-32 میں نہیں۔یہ منفرد خصوصیت شناخت اور حساسیت کی حد کے حوالے سے UCOMs کی کارکردگی کو نمایاں طور پر بہتر بناتی ہے۔نمونوں میں کینسر کے خلیوں کے 2% سے بھی کم فرق کیا جا سکتا ہے، جو UCOMs کو زیادہ تر موجودہ بائیو مارکر کے مقابلے میں بہت زیادہ حساس بائیو مارکر بناتا ہے 30۔ بڑی آنت کے کینسر کا پتہ لگانے کے لیے استعمال ہونے والے بائیو مارکر کے طور پر، KRAS تغیرات صرف کولوریکٹل کینسر کے تقریباً 36% کیسوں میں موجود ہیں، تجویز کرنا ناقص تشخیصی صلاحیت33۔کولوریکٹل کینسر میں KRAS اتپریورتنوں کا کم پھیلاؤ دوسرے بائیو مارکر کے ساتھ مل کر KRAS کو محدود کرتا ہے۔درحقیقت، بائیو مارکرز کا مجموعہ ابتدائی طور پر امید افزا معلوم ہو سکتا ہے، لیکن پتہ لگانے کے تجزیے میں بہت زیادہ شور کا مظاہرہ کرتے ہوئے ہمیشہ تسلی بخش نتیجہ پیدا نہیں کرتا اور عام طور پر اس میں زیادہ پیچیدہ تجرباتی طریقہ کار شامل ہوتا ہے۔اس کے برعکس، PCDHGB7 اور دیگر UCOMs تمام کینسر میں موجود ہیں۔UCOMs مختلف قسم کے کینسر کے نمونوں میں انتہائی درستگی کے ساتھ کینسر کے اجزاء کا پتہ لگاتے ہیں جبکہ شور کو منسوخ کرنے والے پیچیدہ تجزیہ کے عمل کو ختم کرتے ہیں۔بہت زیادہ نمونے میں کینسر کا پتہ لگانا مشکل نہیں ہے، لیکن چھوٹے نمونے میں کینسر کا پتہ لگانا انتہائی مشکل ہے۔UCOMs کینسر کی تھوڑی مقدار کا پتہ لگانے کی صلاحیت رکھتے ہیں۔

تصویر 2 UCOMs کی خصوصیات۔

پیتھولوجیکل تبدیلیوں سے پہلے کینسر کا پتہ لگانا

پیتھولوجیکل تبدیلیوں سے پہلے کینسر سے پہلے کے مرحلے میں UCOMs کا پتہ لگایا جاسکتا ہے۔ایپی جینیٹک بائیو مارکر کے طور پر، UCOM کی اسامانیتایاں فینوٹائپک اسامانیتاوں کے مقابلے میں ابتدائی مرحلے میں ہوتی ہیں اور ٹیومرجینیسیس، ترقی، اور میٹاسٹیسیس 34,35 میں قابل شناخت ہیں۔وقت کے ساتھ UCOM کی حساسیت ابتدائی مرحلے کے کینسر اور کینسر سے پہلے کے گھاووں کا پتہ لگانے میں UCOM کی کارکردگی کو بڑھاتی ہے۔بایوپسی اور سائٹولوجی کی بنیاد پر ابتدائی کینسر کا پتہ لگانا یہاں تک کہ تجربہ کار پیتھالوجسٹ کے لیے بھی مشکل ہو سکتا ہے۔60.6% HSIL+ نمونوں میں کولپوسکوپی کے ذریعے حاصل کردہ ایک بایپسی کو مثبت بتایا گیا ہے۔حساسیت کو بڑھانے کے لیے متعدد گھاووں کے لیے اضافی بایپسی کی ضرورت ہوتی ہے۔اس کے برعکس، UCOM، PCDHGB7، HSIL+ کے نمونوں کے لیے 82% کی حساسیت رکھتا ہے، جو بایوپسیوں اور زیادہ تر بائیو مارکر30 کی حساسیت کو پیچھے چھوڑتا ہے۔میتھیلیشن مارکر، FAM19A4، CIN2+ کے لیے 69% کی حساسیت رکھتا ہے، جو کہ سائٹولوجی کی طرح ہے، لیکن CIN1 کو عام نمونوں سے مختلف نہیں کر سکتا۔UCOMs کو بہت زیادہ حساس ابتدائی پتہ لگانے والا بائیو مارکر دکھایا گیا ہے۔تجربے پر مبنی پیتھالوجسٹ کے مقابلے میں، UCOMs میں ابتدائی مرحلے کے کینسر کے لیے اعلیٰ شناختی حساسیت ہوتی ہے، جس کے نتیجے میں کینسر کی تشخیص اور بقا میں بہتری آتی ہے۔مزید برآں، UCOMs ایک پتہ لگانے کا پلیٹ فارم پیش کرتے ہیں جو ان علاقوں تک قابل رسائی ہے جہاں تجربہ کار پیتھالوجسٹ کی کمی ہے اور پتہ لگانے کی کارکردگی کو بہت بہتر بناتا ہے۔یکساں نمونے لینے اور پتہ لگانے کے طریقہ کار کے ساتھ، UCOM کا پتہ لگانے سے مستحکم اور آسانی سے تشریح کرنے والے نتائج برآمد ہوتے ہیں جو اسکریننگ پروٹوکول کے مطابق ہوتے ہیں جس میں کم پیشہ ور افراد اور طبی وسائل کی ضرورت ہوتی ہے۔

پتہ لگانے میں آسان

ڈی این اے میتھیلیشن کا پتہ لگانے کے موجودہ طریقے پیچیدہ اور وقت طلب ہیں۔زیادہ تر طریقوں میں بیسلفائٹ کی تبدیلی کی ضرورت ہوتی ہے، جو نمونے کے معیار میں نقصان کا سبب بنتا ہے اور ممکنہ طور پر غیر مستحکم اور غلط نتائج پیدا کرتا ہے۔بیسلفائٹ ٹریٹمنٹ کی وجہ سے پیدا ہونے والی ناقص تولیدی صلاحیت ممکنہ طور پر معالجین اور مریضوں کے لیے الجھن کا باعث بنتی ہے اور مزید تعاقب اور/یا علاج کی حکمت عملیوں میں مداخلت کرتی ہے۔لہٰذا، ہم نے UCOM کا پتہ لگانے کے طریقہ کار میں مزید ترمیم کی تاکہ نمونوں کے بیسلفائٹ ٹریٹمنٹ سے بچا جا سکے، طبی درخواست کی ضروریات کو پورا کیا جا سکے، اور رسائی کو بڑھایا جا سکے۔ہم نے میتھیلیشن-حساس پابندی والے خامروں کا استعمال کرتے ہوئے ایک نیا طریقہ تیار کیا ہے جس میں ریئل ٹائم فلوروسینٹ مقداری PCR (Me-qPCR) کے ساتھ مل کر UCOMs کی میتھیلیشن کی حیثیت کو 3 گھنٹے کے اندر اندر ہینڈلنگ کے آسان طریقہ کار (شکل 3) کا استعمال کیا جا سکتا ہے۔Me-qPCR متعدد نمونوں کی اقسام کو ایڈجسٹ کر سکتا ہے، جیسے کہ جسمانی رطوبتوں کا طبی مجموعہ اور خود جمع کردہ پیشاب کے نمونے۔جمع کیے گئے طبی نمونے معیاری اور خودکار ڈی این اے نکالنے کا استعمال کرتے ہوئے پروسیس کیے جا سکتے ہیں، محفوظ کیے جا سکتے ہیں اور آسانی سے پتہ لگانے کے لیے آگے بڑھ سکتے ہیں۔نکالا DNA پھر ایک برتن کے رد عمل اور آؤٹ پٹ کوانٹیفیکیشن کے نتائج کے لیے براہ راست Me-qPCR پلیٹ فارم پر لاگو کیا جا سکتا ہے۔تشخیصی ماڈلز کا استعمال کرتے ہوئے سادہ نتائج کے تجزیے کے بعد کینسر کی مخصوص اقسام کے لیے موزوں اور تصدیق شدہ، UCOM پتہ لگانے کے نتائج کے حتمی تعین کی تشریح کی جاتی ہے اور اسے نیم مقداری قدر کے طور پر پیش کیا جاتا ہے۔EZ DNA میتھیلیشن-گولڈ کٹ پروٹوکول کے مطابق، Me-qPCR پلیٹ فارم UCOM پتہ لگانے میں روایتی bisulfite-pyrosequencing سے بہتر کارکردگی کا مظاہرہ کرتا ہے۔جدید میتھیلیشن کا پتہ لگانے والا پلیٹ فارم UCOM کا پتہ لگانے کو مستحکم، زیادہ درست اور زیادہ قابل رسائی بناتا ہے۔

شکل 3 UCOMs کا پتہ لگانے کا عمل۔نمونوں کی اقسام میں پیشہ ورانہ طور پر نمونے لیے گئے BALF، Pap برش، اور/یا خود جمع کردہ پیشاب شامل ہیں۔ڈی این اے نکالنے کے عمل کو ایک خودکار ایکسٹریکٹر میں ایڈجسٹ کیا جا سکتا ہے، جس کی پروڈکٹ کا براہ راست qPCR کے ذریعے پتہ لگایا جا سکتا ہے۔

UCOMs کی درخواست

پھیپھڑوں کے کینسر

پھیپھڑوں کا کینسر دنیا بھر میں دوسرا سب سے زیادہ کثرت سے تشخیص ہونے والا اور سب سے زیادہ مہلک کینسر ہے، جو کہ 11.4% نئے کیسز اور 18.0% نئی اموات کا باعث بنتا ہے۔تمام تشخیصات میں سے، 85% غیر چھوٹے سیل پھیپھڑوں کا کینسر (NSCLC) اور 15% چھوٹے خلیے کے پھیپھڑوں کے کینسر (SCLC) ہیں، جن میں مہلکیت کی اعلی سطح ہوتی ہے۔کم خوراک کمپیوٹیڈ ٹوموگرافی (LDCT) اسکیننگ پھیپھڑوں کے کینسر کے لیے فی الحال تجویز کردہ اسکریننگ کا طریقہ ہے اور اسے جلد پتہ لگانے اور اموات کو کم کرنے کے لیے دکھایا گیا ہے۔تاہم، کم مخصوصیت اور ناقص رسائی کی وجہ سے، LDCT نے ابھی تک ایک تسلی بخش اسکریننگ کے طریقہ کار کے طور پر کام کرنا ہے، جیسا کہ دیگر عام کینسر مارکر، جیسے CEA39۔ایل ڈی سی ٹی اسکریننگ کی حکمت عملی کی کھوئی ہوئی تشخیص اور غلط تشخیص کے اخراجات اور امکانات پھیپھڑوں کے کینسر کی اسکریننگ پروموشن40 کی پیشرفت میں رکاوٹ ہیں۔HIST1H4F، ایک UCOM، برونچوئلولر فلوئڈ (BALF) کے نمونوں میں ابتدائی پتہ لگانے والے بائیو مارکر کے طور پر بہت زیادہ صلاحیت رکھتا ہے۔HIST1H4F پھیپھڑوں کے اڈینو کارسینوما اور پھیپھڑوں کے اسکواومس سیل کارسنوما میں ہائپر میتھلیٹیڈ ہے، جس کی نشاندہی کی خصوصیت 96.7٪ اور حساسیت 87.0٪ (شکل 4A) ہے، اور اسٹیج I کینسر27 کے لیے ایک غیر معمولی کارکردگی ہے۔HIST1H4F کی مخصوصیت 96.5% ہے اور NSCLC کے لیے 85.4% حساسیت ہے، اور SCLC27 کے لیے بالترتیب 96.5% اور 95.7% ہے۔مزید برآں، کینسر کی آٹھ دیگر اقسام کے نمونے، بشمول لبلبہ اور کولوریکٹل کینسر، نے توثیق کی ہے کہ HIST1H4F تمام آٹھ اقسام میں ہائپر میتھلیٹیڈ ہے۔

رحم کے نچلے حصے کا کنسر

گریوا کا کینسر چوتھا سب سے زیادہ کثرت سے تشخیص ہونے والا کینسر تھا اور 2020 میں خواتین میں کینسر سے ہونے والی اموات کی چوتھی بڑی وجہ تھی، جو کہ عالمی سطح پر 3.1% نئے کیسز اور کینسر سے ہونے والی اموات کا 3.4% ہے۔2030 تک سروائیکل کینسر کو ختم کرنے کے لیے، جیسا کہ ڈبلیو ایچ او کی تجویز ہے، سروائیکل کینسر کا جلد پتہ لگانا ضروری ہے۔اگر ابتدائی مرحلے میں پتہ چلا تو 5 سال کی بقا کی شرح ناگوار سروائیکل کینسر41 کے ساتھ 92 فیصد تک پہنچ جاتی ہے۔امریکن کینسر سوسائٹی (ACS) کے رہنما خطوط سروائیکل سائیٹولوجی ٹیسٹ، پرائمری HPV ٹیسٹ، یا اسکریننگ 42 کے لیے ٹیسٹ تجویز کرتے ہیں۔سروائیکل سائیٹولوجی ناگوار ہے اور صرف 63.5% CIN2+ کیسز کا پتہ لگا سکتی ہے۔

PCDHGB7، اس کے برعکس، Pap smears اور vaginal secretions کے استعمال سے بہت بہتر کارکردگی کا مظاہرہ کرتا ہے، اور HSIL کو انتہائی ابتدائی مرحلے میں LSIL سے مؤثر طریقے سے ممتاز کر سکتا ہے۔اکیلے PCDHGB7 میں 100.0% کی حساسیت اور سروائیکل کینسر (شکل 4B) کے لیے 88.7% کی مخصوصیت ہے، اور HSIL+ نمونوں کے لیے 82.1% حساسیت اور 88.7% مخصوصیت ہے۔PCDHGB7 میں گریوا کینسر کے لیے اندام نہانی کے رطوبت کے نمونوں میں 90.9% حساسیت اور 90.4% مخصوصیت بھی ہے، جنہیں اکٹھا کرنا بہت آسان ہے۔جب ہائی رسک (hr)HPV ٹیسٹ یا Thinprep Cytology Test (TCT) کے ساتھ ملایا جائے تو PCDHGB7 کی حساسیت 95.7% اور خاصیت 96.2% ہے، جو نمایاں طور پر hrHPV ٹیسٹ (20.3%)، TCT (51.2%) سے زیادہ ہے۔ )، اور دونوں کو ملا کر (57.8%) سروائیکل کینسر30 کے لیے۔پی سی ڈی ایچ جی بی 7 کو ٹی سی جی اے ڈیٹا بیس سے کینسر کی 17 اقسام میں ہائپر میتھلیٹڈ بھی دکھایا گیا ہے، جو UCOM فیملی 30 میں اس کی مناسبیت کی نشاندہی کرتا ہے۔

شکل 4 بڑے پیمانے پر طبی مطالعات میں کینسر کی چار اقسام میں UCOMs کی توثیق کی گئی ہے۔A. HIST1H4F کی کارکردگی، ایک UCOM، 508 نمونوں میں پھیپھڑوں کے کینسر کا پتہ لگانے میں۔B. PCDHGB7 کی کارکردگی، ایک UCOM، 844 نمونوں کے سروائیکل کینسر کا پتہ لگانے میں۔C. 577 اینڈومیٹریال پیپ اور تاؤ برش کے نمونوں کے اینڈومیٹریال کینسر کا پتہ لگانے میں PCDHGB7، ایک UCOM کی کارکردگی۔D. SIX6 کی کارکردگی، ایک UCOM، 177 نمونوں کے urothelial کینسر کا پتہ لگانے میں۔

EC

EC دنیا بھر میں خواتین کے تولیدی نظام کے سب سے عام کینسروں میں سے ایک ہے، جس میں اندازے کے مطابق 4.2 ملین نئے کیسز اور سالانہ 1% کینسر سے ہونے والی اموات ہیں۔ابتدائی مرحلے میں کامیاب تشخیص کے ساتھ، EC قابل علاج ہے اور اسٹیج I کینسر کے لیے 5 سالہ بقا کی شرح 95% ہے۔ایسے مریض جو علامتی ہوتے ہیں، جیسے کہ بچہ دانی کا غیر معمولی خون بہنا، وقتاً فوقتاً طبی تشخیص حاصل کرتے ہیں اور ان کی ناگوار اور تکلیف دہ بایپسی کے طریقہ کار سے گزرنا پڑتا ہے، اس کے باوجود کہ صرف 5%–10% بالآخر EC43 کی نشوونما کرتا ہے۔ٹرانس ویجینل الٹرا ساؤنڈ، عام پتہ لگانے کے طریقہ کے طور پر، مہلک اینڈو میٹریل تبدیلیوں اور اعلی غلط مثبت شرح44 سے سومی کو فرق کرنے میں ناکام ہونے کی وجہ سے انتہائی ناقابل اعتبار ہے۔

سیرم CA-125، ایک وسیع پیمانے پر نافذ کردہ EC بائیو مارکر، اور PCDHGB7 کا متوازی موازنہ کیا گیا۔سیرم CA-125 کی حساسیت 24.8% تھی، جس سے پتہ چلتا ہے کہ CA-125 92.3%31 کی مخصوصیت کے باوجود EC کے لیے ناکافی مارکر ہے۔پی پی برش کے نمونوں کا استعمال کرتے ہوئے PCDHGB7 کا پتہ لگانے سے ECatall مراحل کے لیے 80.65% کی حساسیت اور 82.81% کی مخصوصیت حاصل ہوئی، جب کہ Tao برش کی حساسیت 61.29% اور مخصوصیت 95.31%31 تھی۔Me-qPCR پر مبنی PCDHGB7 تشخیصی ماڈل نے Pap اور Tao برش کے نمونے (Figure 4C) 31 کا استعمال کرتے ہوئے، 98.61% کی حساسیت، 60.5% کی مخصوصیت، اور مجموعی طور پر 85.5% کی درستگی حاصل کی۔

یوروتھیلیل کینسر

یوروتھیلیل کینسر، جو مثانے، گردوں کے شرونی اور پیشاب کے کینسر پر مشتمل ہے، دنیا بھر میں 2020 میں اکثر تشخیص ہونے والا ساتواں کینسر تھا، جس کی وجہ سے 5.2% نئے کیسز اور 3.9% اموات ہوئیں۔یوروتھیلیل کینسر، جن میں سے 50% سے زیادہ مثانے کے کینسر ہیں، 2022 میں ریاستہائے متحدہ میں چوتھے سب سے زیادہ کثرت سے تشخیص ہونے والے کینسر تھے، جو کہ نئے تشخیص شدہ کیسز میں سے 11.6 فیصد ہیں۔تقریباً 75% مثانے کے کینسر کو غیر عضلاتی ناگوار مثانے کے کینسر کے طور پر درجہ بندی کیا جاتا ہے جو میوکوسا یا submucosa45 تک محدود ہے۔سیسٹوسکوپی بایپسی یوروتھیلیل کینسر کی تشخیص کے لیے سنہری معیار ہے جسے فلوروسینس ان سیٹو ہائبرڈائزیشن (FISH) اور سائٹولوجی ٹیسٹ کے ذریعے لاگو کیا جاتا ہے۔FISH اور سائیٹولوجی کی خراب تشخیصی کارکردگی ہے، اور cystoscopy دخل اندازی کرتی ہے اور اس میں مائیکرو لیشنز غائب ہونے، زخموں کی غلط تشریح، اور ممکنہ طور پر کینسر کے پھیلنے یا دوبارہ شروع ہونے کا بنیادی خطرہ ہوتا ہے۔پہلے توثیق شدہ UCOM، PCDHGB7، کو بھی یوروتھیلیل کینسر میں ہائپرمیتھلیٹڈ دکھایا گیا تھا، جس کا رقبہ 0.86 کے منحنی خطوط کے ساتھ ہے، جو ممکنہ تشخیصی صلاحیت کی تجویز کرتا ہے۔مزید UCOMs کی مزید توثیق کرنے اور مزید نمونوں کی اقسام کو بہتر طور پر ایڈجسٹ کرنے کے لیے، SIX6، ایک ناول UCOM، کا معائنہ کیا گیا اور Me-qPCR پلیٹ فارم پر پیشاب کے نمونوں کا استعمال کرتے ہوئے یوروتھیلیل کینسر کی ابتدائی تشخیص میں بہترین تشخیصی صلاحیت کو ظاہر کیا۔پیشاب کے نمونوں کا استعمال کرتے ہوئے SIX6 کا پتہ لگانے سے 86.7% کی مسابقتی حساسیت اور 90.8% کی خصوصیت (شکل 4D) ظاہر ہوئی، جبکہ یہ غیر جارحانہ اور حاصل کرنے میں آسان ہے32۔میٹاسٹیسیس کی نگرانی اور علاج کی افادیت کی تشخیص میں SIX6 کی صلاحیت فی الحال زیر تفتیش ہے۔

مستقبل اور چیلنجز

متعدد کینسروں کی تشخیصی صلاحیت میں UCOMs کی کارکردگی مضبوط ہے، لیکن ابھی بہت کام کرنا باقی ہے۔ہم UCOMs کی فہرست کو بڑھا رہے ہیں اور کینسر کی مزید اقسام میں فعال طور پر UCOMs کی توثیق کر رہے ہیں، بشمول وہ جن کا پتہ لگانا روایتی طور پر مشکل ہے۔TCGA ڈیٹا بیس سے توثیق کے نتائج نے کینسر کی مزید اقسام اور مزید حالات میں UCOMs کی درخواست کی مزید تصدیق کی ہے۔ابتدائی تحقیقات میں، UCOMs میں cholangiocarcinomas اور pancreatic adenocarcinomas کی مضبوط تشخیصی صلاحیت کو ظاہر کیا گیا ہے، جن کی موجودہ اسکریننگ کے طریقوں سے ابتدائی مرحلے میں تشخیص کرنا تقریباً ناممکن ہے 32,47۔UCOMs کے ساتھ نایاب کینسر کا پتہ لگانے کی صلاحیت کو ایک بہتر مائع بایپسی پلیٹ فارم 48 کے ذریعے گردش کرنے والے ٹیومر DNA (ctDNA) کے ساتھ استعمال کیا جا سکتا ہے۔پلازما ڈی این اے پر مبنی پین کینسر کا پتہ لگانے والے پینل پر مشتمل ایک مطالعہ نے 57.9%49 کی حساسیت حاصل کی۔اعلی خاصیت کے باوجود، مجموعی کارکردگی سے پتہ چلتا ہے کہ بہتری کی ابھی بھی گنجائش ہے۔

UCOMs کی منفرد خصوصیات نے علاج کی افادیت کی تشخیص اور تکرار کی نگرانی میں UCOM کی صلاحیت کی تحقیقات میں بھی مدد کی ہے۔ٹھوس ٹیومر (RECIST) میں ردعمل کی تشخیص کے معیار کے مطابق، میڈیکل امیجنگ تکرار کی نگرانی اور علاج کی افادیت کی تشخیص کے لیے تجویز کردہ طریقہ کار ہے، جبکہ ٹیومر مارکر تشخیص کے لیے اکیلے استعمال کیے جاتے ہیں۔حقیقت میں، تاہم، امیجنگ اپروچ فریکوئنسی اور ٹائمنگ سے بہت متاثر ہوتے ہیں، اور اس وجہ سے مریضوں کو زیادہ خطرہ اور لاگت51,52 کا سامنا کرنا پڑتا ہے۔چھاتی کے کینسر کے میٹاسٹیسیس 32 کے پیش گو کے طور پر کام کرنے کے لیے SIX6 کی توثیق کی گئی ہے۔مائع بایپسی پر مبنی سی ٹی ڈی این اے مانیٹرنگ ریڈیولوجک پتہ لگانے سے پہلے کم سے کم بقایا بیماری پر حقیقی وقت کی نگرانی کے قابل بناتی ہے، مثالی طور پر دوبارہ لگنے سے متعلق کینسر کے بڑھنے میں تاخیر اور روک تھام53۔ابتدائی نتائج بتاتے ہیں کہ UCOMs سرجری اور علاج کے فوراً بعد حقیقی وقت میں کینسر کے ہائپرمیتھیلیشن کی سطح کو ظاہر کرتا ہے۔UCOMs کی طرف سے ظاہر کی گئی اعلیٰ حساسیت اور متعدد غیر دخل اندازی نمونوں کی اقسام میں قابل اطلاق UCOMs کو مریض کی اعلی تعمیل کو برقرار رکھتے ہوئے ایک درست ریکرینس مانیٹرنگ بائیو مارکر کے طور پر کام کرنے کی اجازت دیتا ہے۔

اسی وقت، ٹیسٹ تک عوام کی رسائی ایک اور بڑا مسئلہ ہے جس کے لیے اضافی کوشش کی ضرورت ہے۔جبکہ UCOM کا پتہ لگانے کے تعاون کو زیادہ سے زیادہ مریضوں کو فائدہ پہنچانے کی امید میں مزید ہسپتالوں میں اپنایا گیا ہے، چین کے دیہی علاقوں میں پرو بونو کا پتہ لگانے اور اسکریننگ کو فعال طور پر انجام دیا گیا ہے۔UCOMs کو ایک قابل عمل اسکریننگ ٹول کے طور پر اہل ہونے کے لیے بہتر رسائی کی ضرورت ہوتی ہے، خاص طور پر پسماندہ علاقوں کے لیے۔

اگرچہ ابتدائی پتہ لگانے میں UCOM ایپلیکیشن کے نتائج امید افزا ہیں، UCOM کے بارے میں بہت سے نامعلوم موجود ہیں۔فعال تلاش کے ساتھ، اضافی تحقیق کی تصدیق کی جاتی ہے کہ کیوں UCOMs کینسر میں عالمی طور پر موجود ہیں۔UCOMs کے تحت بنیادی ایپی جینیٹک ریگولیشن میکانزم مزید تفتیش کے قابل ہیں، جو کینسر کے علاج کے لیے ایک نئی سمت کا جواز پیش کر سکتے ہیں۔ٹیومر یکسانیت اور متفاوت کے مابین تعامل کی طرف لوٹتے ہوئے ، ہم اس میں دلچسپی رکھتے ہیں کہ کیوں UCOMs کینسر کے بائیو مارکر کی اکثریت سے مستثنیٰ ہوسکتے ہیں جو کینسر کی مخصوص اقسام سے مضبوطی سے جڑے ہوئے ہیں۔خلیوں کی شناخت کھونے اور دوبارہ حاصل کرنے کے عمل میں ٹیومرجینیسیس، ٹیومر بڑھنے، اور میٹاسٹیسیس میں UCOM کی شناخت شدہ DNA میتھیلیشن ابریشن کے کردار کا تعین نہیں کیا گیا ہے اور اس کے لیے مکمل معائنہ کی ضرورت ہے۔ایک اور بڑی دلچسپی کینسر کے نشانات کے درست پتہ لگانے اور الٹے انداز میں ٹیومر کے بافتوں کی اصلیت کی شناخت کے قریب پہنچنے کی امید میں ٹشو-منفرد مارکر کے ساتھ UCOMs کی یکسانیت کی خصوصیت کو شامل کرنے کے دائرہ کار میں ہے۔UCOMs کینسر کو روکنے، کینسر کا پتہ لگانے، اور ممکنہ طور پر کینسر کا دفاع کرنے اور اسے ختم کرنے کے لیے ایک مثالی آلہ بن سکتا ہے۔

تعاون فراہم کریں۔

اس کام کو چین کے قومی کلیدی R&D پروگرام (گرانٹ نمبر 2022BEG01003)، چائنا کی نیشنل نیچرل سائنس فاؤنڈیشن (گرانٹ نمبر 32270645 اور 32000505)، ہیلونگ جیانگ صوبائی ہیلتھ کمیشن (گرانٹ نمبر 1-2010) کی طرف سے ایک گرانٹ کے ذریعے تعاون کیا گیا۔ ، اور ہیز سائنس اینڈ ٹیکنالوجی انسٹی ٹیوٹ سے گرانٹ (گرانٹ نمبر 2021KJPT07)۔

مفادات کا تصادم کا بیان

وی لی شنگھائی ایپی پروب بائیوٹیکنالوجی کمپنی لمیٹڈ کے آر اینڈ ڈی ڈائریکٹر ہیں۔ وینکیانگ یو ایپی پروب کے سائنسی مشاورتی بورڈ میں خدمات انجام دیتے ہیں۔W. Yu اور Epiprobe نے اس کام سے متعلق زیر التواء پیٹنٹ کی منظوری دے دی ہے۔دیگر تمام مصنفین مسابقتی مفادات کا اعلان نہیں کرتے ہیں۔

مصنف کی شراکتیں۔

اس منصوبے کا تصور اور ڈیزائن کیا گیا: Chengchen Qian اور Wenqiang Yu.

کاغذ لکھا: Chengchen Qian.

مثالیں بنائیں: چینگچن کیان۔

مخطوطہ کا جائزہ لیا اور اس میں ترمیم کی: Xiaolong Zou، Wei Li، Yinshan Li اور Wenqiang Yu۔

حوالہ جات

1. سنگ H، Ferlay J، Siegel RL، LaversanneM، Soerjomataram I، Jemal A، et al.عالمی کینسر کے اعدادوشمار 2020: GLOBOCAN کا تخمینہ

دنیا بھر میں 185 ممالک میں 36 کینسر کے واقعات اور اموات۔CA کینسر جے کلین۔2021;71: 209-49۔

2. Xia C, Dong X, Li H, Cao M, Sun D, ​​He S, et al.چین اور ریاستہائے متحدہ میں کینسر کے اعدادوشمار، 2022: پروفائلز، رجحانات، اور تعین کنندگان۔چن میڈ جے (انگلش)۔2022;135: 584-90۔

3. سیگل آر ایل، ملر کے ڈی، ویگل این ایس، جیمال اے۔کینسر کے اعدادوشمار، 2023۔ CA کینسر جے کلین۔2023;73:17-48۔

4. Crosby D, BhatiaS, Brindle KM, Coussens LM, Dive C, Emberton M, et al.کینسر کا ابتدائی پتہ لگانا۔سائنس۔2022;375: eaay9040۔

5. Ladabaum U، Dominitz JA، KahiC، Schoen RE.کے لیے حکمت عملی

کولوریکٹل کینسر اسکریننگ.معدے.2020;158: 418-32۔

6. Tanoue LT، Tanner NT، Gould MK، Silvestri GA.پھیپھڑوں کے کینسر کی اسکریننگ۔ایم جے ریسپر کریٹ کیئر میڈ۔2015;191: 19-33۔

7. Bouvard V، WentzensenN، Mackie A، Berkhof J، BrothertonJ، Giorgi-Rossi P، et al.گریوا کینسر کی اسکریننگ پر IARC کا نقطہ نظر۔این انگل جے میڈ۔2021;385: 1908-18۔

8. Xue P, Ng MTA, QiaoY.LMICs میں سروائیکل کینسر کی اسکریننگ کے لیے کولپوسکوپی کے چیلنجز اور مصنوعی ذہانت کے ذریعے حل۔بی ایم سی میڈ2020;18 : 169 .

9. جانسن پی، زو کیو، ڈاؤ ڈی وائی، لو وائی ایم ڈی۔ہیپاٹو سیلولر کارسنوما کی تشخیص اور انتظام میں بائیو مارکر گردش کرنا۔Nat Rev Gastroenterol Hepatol.2022;19: 670-81۔

10. Van PoppelH, Albreht T, Basu P, HogenhoutR, CollenS, Roobol M. Serum PSA کی بنیاد پر یورپ اور عالمی سطح پر پروسٹیٹ کینسر کا ابتدائی پتہ لگانا: ماضی، حال اور مستقبل۔نیٹ ریو یورول۔2022;19:

562-72۔

11. HolyoakeA, O'Sullivan P, Pollock R, Best T, Watanabe J, KajitaY,

ET رحمہ اللہ تعالی.مثانے کے عبوری سیل کارسنوما کا پتہ لگانے اور اس کی سطح بندی کے لیے ملٹی پلیکس آر این اے پیشاب ٹیسٹ کی ترقی۔کلین کینسر ریس.2008;14: 742-9۔

12. Feinberg AP، Vogelstein B. Hypomethylation کچھ انسانی کینسروں کے جین کو ان کے عام ہم منصبوں سے ممتاز کرتا ہے۔فطرت1983;301: 89-92۔

13. Ng JM، Yu J. ٹیومر کو دبانے والے جینز کا پروموٹر ہائپر میتھیلیشن آنتوں کے کینسر میں ممکنہ بائیو مارکر کے طور پر۔IntJ Mol Sci.2015;16: 2472-96۔

14. ایسٹیلر ایم. کینسر ایپی جینومکس: ڈی این اے میتھائلومس اور ہسٹون میں ترمیم کے نقشے۔نیٹ ریو جینیٹ۔2007;8: 286-98۔

15. نیشیاما اے، ناکانیشی ایم. کینسر کے ڈی این اے میتھیلیشن لینڈ سکیپ پر تشریف لے جا رہے ہیں۔رجحانات جینیٹ۔2021;37: 1012-27۔

16. Xie W, Schultz MD, ListerR, Hou Z, Rajagopal N, Ray P, et al.انسانی برانن اسٹیم سیلز کے کثیر النوع تفریق کا ایپی جینومک تجزیہ۔سیل2013;153: 1134-48۔

17. Li Y، Zheng H، Wang Q، Zhou C، WeiL، Liu X، et al.جینوم کے وسیع تجزیوں سے ڈی این اے میتھیلیشن وادیوں کے ہائپوومیتھیلیشن کو فروغ دینے میں پولی کامب کے کردار کا پتہ چلتا ہے۔جینوم بائیول۔2018;19:18.

18. Koch A, JoostenSC, Feng Z, de Ruijter TC, DrahtMX, MelotteV,

ET رحمہ اللہ تعالی.کینسر میں ڈی این اے میتھیلیشن کا تجزیہ: مقام پر نظرثانی کی گئی۔نیٹ ریو کلین آنکول۔2018;15: 459-66۔

19. KleinEA، Richards D، Cohn A، TummalaM، Lapham R، Cosgrove D، et al.ایک آزاد توثیق سیٹ کا استعمال کرتے ہوئے ہدف شدہ میتھیلیشن پر مبنی ملٹی کینسر کے ابتدائی پتہ لگانے کے ٹیسٹ کی کلینیکل توثیق۔این اونکول۔2021;32: 1167-77۔

20. ہاناہن ڈی، وینبرگ RA.کینسر کی علامات۔سیل2000;100: 57-70۔

21. ہاناہن D. کینسر کے نشانات: نئی جہتیں۔کینسر ڈسکو۔2022;12:31-46۔

22. Schwartzberg L, Kim ES, Liu D, Schrag D. Precision oncology: who, how, what, when, and when not?ایم سوک کلین آنکول ایجوک بک۔2017: 160-9۔

23. لیو ایچ، مینگ ایکس، وانگ جے ریئل ٹائم مقداری میتھیلیشن

گریوا کینسر کی اسکریننگ میں PAX1 جین کا پتہ لگانا۔IntJ Gynecol کینسر۔2020;30: 1488-92۔

24. Imperiale TF، RansohoffDF، Itzkowitz SH، Levin TR، Lavin P، Lidgard GP، et al.کولوریکٹل کینسر اسکریننگ کے لئے ملٹی ٹارگٹ اسٹول ڈی این اے ٹیسٹنگ۔این انگل جے میڈ۔2014;370: 1287-97۔

25. Li J، Li Y، Li W، Luo H، Xi Y، Dong S، et al.گائیڈ پوزیشننگ

ترتیب غیر معمولی DNA میتھیلیشن پیٹرن کی نشاندہی کرتی ہے جو سیل کی شناخت اور ٹیومر کے مدافعتی نگرانی کے نیٹ ورکس کو تبدیل کرتی ہے۔جینوم

Res.2019;29:270-80۔

26. Gao Q، LinYP، Li BS، Wang GQ، Dong LQ، Shen BY، et al.سیل فری ڈی این اے میتھیلیشن سیکوینسنگ (تھنڈر) کی گردش کے ذریعے غیر مداخلتی کثیر کینسر کا پتہ لگانا: ترقی اور خود مختار توثیق کا مطالعہ۔این اونکول۔2023;34: 486-95۔

27. ڈونگ ایس، لی ڈبلیو، وانگ ایل، ہو جے، سونگ وائی، ژانگ بی، وغیرہ۔ہسٹون سے متعلق جین پھیپھڑوں کے کینسر میں ہائپر میتھلیٹیڈ اور ہائپر میتھلیٹیڈ ہوتے ہیں۔

HIST1H4F پین کینسر بائیو مارکر کے طور پر کام کر سکتا ہے۔کینسر ریس2019;79:6101-12۔

28. HeijnsdijkEA, Wever EM,AuvinenA, Hugosson J, Ciatto S, Nelen V, et al.پروسٹیٹ مخصوص اینٹیجن اسکریننگ کے معیار زندگی کے اثرات۔این انگل جے میڈ۔2012;367: 595-605۔

29. LuzakA, Schnell-Inderst P, Bühn S, Mayer-Zitarosa A, Siebert U. خود تنخواہ والی صحت کی خدمت کے طور پر پیش کردہ کینسر اسکریننگ بائیو مارکر ٹیسٹوں کی کلینیکل تاثیر: ایک منظم جائزہ۔یور جے پبلک ہیلتھ۔2016;26: 498-505۔

30. Dong S, Lu Q, Xu P, Chen L, Duan X, Mao Z, et al.

Hypermethylated PCDHGB7 بطور یونیورسل کینسر صرف مارکر اور ابتدائی سروائیکل کینسر اسکریننگ میں اس کا اطلاق۔کلین ٹرانسل میڈ۔2021;11: ای457۔

31. Yuan J، Mao Z، Lu Q، Xu P، Wang C، Xu X، et al.Hypermethylated PCDHGB7 اینڈومیٹریال برش کے نمونوں اور سروائیکل سکریپنگ میں اینڈومیٹریال کینسر کی جلد پتہ لگانے کے لیے بائیو مارکر کے طور پر۔فرنٹ Mol Biosci.2022;8: 774215 ۔

32. Dong S, Yang Z,Xu P, Zheng W, Zhang B, Fu F, et al.باہمی طور پر

پریکینسرس اسٹیج اور میٹاسٹیسیس ایمرجن ٹریسنگ کے لیے ہائپرمیتھیلیشن کے ساتھ SIX6 پر خصوصی ایپی جینیٹک ترمیم۔سگنل کی نقل و حمل کا ہدف۔2022;7:208۔

33. ہوانگ ایل، گوو زیڈ، وانگ ایف، فو ایل کے آر اے ایس اتپریورتن: کینسر میں ناقابل علاج سے منشیات کے قابل۔سگنل کی نقل و حمل کا ہدف۔2021;6 : 386 .

34. Belinsky SA، Nikula KJ، PalmisanoWA، MichelsR، SaccomannoG، GabrielsonE، et al.p16 (INK4a) کا ابرنٹ میتھیلیشن پھیپھڑوں کے کینسر میں ابتدائی واقعہ ہے اور ابتدائی تشخیص کے لیے ایک ممکنہ بائیو مارکر ہے۔Proc Natl Acad Sci U SA.1998;95: 11891-6۔

35. رابرٹسن کے ڈی۔ڈی این اے میتھیلیشن اور انسانی بیماری۔نیٹ ریو جینیٹ۔2005;6: 597-610۔

36. WentzensenN, Walker JL, Gold MA, Smith KM, ZunaRE,

میتھیوز سی، وغیرہ۔کولپوسکوپی میں ایک سے زیادہ بایپسی اور سروائیکل کینسر کے پیشگی کا پتہ لگانا۔جے کلین آنکول۔2015;33:83-9۔

37. De Strooper LM، Meijer CJ، Berkhof J، Hesselink AT، Snijders

PJ، Steenbergen RD، et al.FAM19A4 کا میتھیلیشن تجزیہ

سروائیکل سکریپ میں جین سروائیکل کا پتہ لگانے میں انتہائی کارگر ہے۔

کارسنوماس اور اعلی درجے کی CIN2/3 گھاو.کینسر پری ریس (فلا)۔2014;7: 1251-7۔

38. Thai AA، Solomon BJ، Sequist LV، Gainor JF، Heist RS.پھیپھڑوں کے کینسر.لینسیٹ2021;398: 535-54۔

39. گرونیٹ ایم، سورینسن جے بی۔پھیپھڑوں کے کینسر میں ٹیومر مارکر کے طور پر کارسینو ایمبریونک اینٹیجن (سی ای اے)۔پھیپھڑوں کے کینسر.2012;76: 138-43۔

40. Wood DE، KazerooniEA، Baum SL، EapenGA، EttingerDS، Hou L، et al.پھیپھڑوں کے کینسر کی اسکریننگ، ورژن 3.2018، آنکولوجی میں NCCN کلینیکل پریکٹس کے رہنما اصول۔J Natl Compr Canc نیٹ ورک۔2018;16: 412-41۔

41. امریکن کینسر سوسائٹی۔کینسر کے حقائق اور اعداد و شمار۔اٹلانٹا، GA، USA: امریکن کینسر سوسائٹی؛2023 [اپ ڈیٹ 2023 مارچ 1;حوالہ دیا گیا 2023 اگست 22]۔

42. FonthamETH, Wolf AMD, Church TR, EtzioniR, Flowers CR,

ہرزگ اے، وغیرہ۔اوسط خطرے والے افراد کے لیے سروائیکل کینسر اسکریننگ: امریکن کینسر سوسائٹی کی جانب سے 2020 گائیڈ لائن اپ ڈیٹ۔CA کینسر جے کلین۔2020;70: 321-46۔

43. Clarke MA, Long BJ, Del Mar MorilloA, Arbyn M, Bakkum-Gamez JN, Wentzensen N. خواتین میں پوسٹ مینوپاسل خون کے ساتھ اینڈومیٹریال کینسر کے خطرے کی ایسوسی ایشن: ایک منظم جائزہ اور میٹا تجزیہ۔JAMA انٹرن میڈ۔2018;178: 1210-22۔

44. جیکبز اول، جنٹری-مہاراجہ، برنیل ایم، منچندر، سنگھ این،

شرما اے، وغیرہ۔ٹرانس ویگنل الٹراساؤنڈ اسکریننگ کی حساسیت

پوسٹ مینوپاسل خواتین میں اینڈومیٹریال کینسر کے لیے: UKCTOCS کوہورٹ کے اندر کیس کنٹرول اسٹڈی۔لینسیٹ آنکول۔2011;12:38-48۔

45. BabjukM, Burger M, CompératEM, Gontero P, MostafidAH,

پالو جے، وغیرہ۔یوروپی ایسوسی ایشن آف یورولوجی کے رہنما خطوط غیر عضلاتی ناگوار مثانے کے کینسر (TaT1 اور کارسنوما ان سیٹو) -

2019 کی تازہ کاری۔یور یورول۔2019;76: 639-57۔

46. ​​آراگون چنگ جے بی۔یوروتھیلیل اوپری نالی اور مثانے کے کارسنوماس کی تشخیص، حیاتیات، اور علاج میں چیلنجز اور پیشرفت۔یورول آنکول۔2017;35: 462-4۔

47. رضوی ایس، خان ایس اے، ہالیمیئر سی ایل، کیلی آر کے، گورس جی جے۔

Cholangiocarcinoma - ارتقاء پذیر تصورات اور علاج کی حکمت عملی۔نیٹ ریو کلین آنکول۔2018;15:95-111۔

48. Ye Q, Ling S, Zheng S, Xu X. ہیپاٹو سیلولر میں مائع بایپسی

کارسنوما: گردش کرنے والے ٹیومر کے خلیات اور گردش کرنے والے ٹیومر ڈی این اے۔مول کینسر۔2019;18:114۔

49. Zhang Y، Yao Y، Xu Y، Li L، Gong Y، Zhang K، et al.پین کینسر

10،000 سے زیادہ چینی مریضوں میں گردش کرنے والے ٹیومر ڈی این اے کا پتہ لگانا۔نیٹ کمیون۔2021;12:11۔

50. Eisenhauer EA, Therasse P, BogaertsJ, Schwartz LH, Sargent D, Ford R, et al.ٹھوس ٹیومر میں ردعمل کی تشخیص کا نیا معیار: نظر ثانی شدہ RECIST گائیڈ لائن (ورژن 1.1)۔یور جے کینسر۔2009;45: 228-47۔

51. LitièreS, Collette S, de Vries EG, Seymour L, BogaertsJ.RECIST - مستقبل کی تعمیر کے لیے ماضی سے سیکھنا۔نیٹ ریو کلین آنکول۔

2017;14: 187-92۔

52. سیمور ایل، بوگارٹس جے، پیرون اے، فورڈ آر، شوارٹز ایل ایچ، مانڈریکر ایس، وغیرہ۔iRECIST: ٹرائلز میں استعمال کے لیے جوابی معیار کے لیے رہنما اصول

امیونو تھراپی کی جانچ۔لینسیٹ آنکول۔2017;18: e143-52۔

53. PantelK، Alix-Panabières C. مائع بایپسی اور کم سے کم بقایا بیماری - علاج کے لیے تازہ ترین پیشرفت اور مضمرات۔نیٹ ریو کلین آنکول۔2019;16: 409-24۔

اس مضمون کو بطور حوالہ دیں: Qian C, Zou X, Li W, Li Y, Yu W. کینسر کے خلاف چوکی: صرف عالمگیر کینسر کے نشانات۔کینسر بائیول میڈ۔2023;20: 806-815۔

doi: 10.20892/j.issn.2095-3941.2023.0313